信息国家研究中心、自动化系团队与斯坦福研究团队合作提出整合单细胞及群体细胞多组学数据的统一数学框架

10月10日,清华大学信息国家研究中心、自动化系江瑞研究团队和斯坦福大学统计系Wing H. Wong研究团队在Nature Communications上在线发表了题为“DC3 is a method for deconvolution and coupled clustering from bulk and single-cell genomics data”的论文,将基因调控网络建模推进到单细胞层面,提出了整合单细胞多组学数据和细胞群体组学数据的统一数学框架DC3,克服单细胞层面样本难以匹配的困难,能够对单细胞多组学数据进行更准确的聚类。同时突破三维基因组学数据难以在单细胞层次观测的瓶颈,实现对群体数据进行解卷积分解。大量的模拟实验表示,DC3可以成功地将群体测序数据解卷积为细胞亚群特异的数据。同时,亚群特异数据反过来改善单细胞水平数据的联合聚类结果。

论文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-019-12547-1